遺址分層

小珠山遺址文化堆積分三層：下層石器以打制的為主，器形有刮削器、盤狀器、網墜、石球以及磨盤、磨棒。磨制石器僅石斧一種。發現有骨器。陶器以含滑石黑褐陶為主，均為手制，器形簡單，主要是一種粗陶直口筒形罐，紋飾多豎“之”字形線紋，另有少量刻劃紋。獸骨的種類有鹿、獐、狗,以鹿為多；還有一定數量的貝殼。

在中層發現有居住面、柱洞等建筑殘跡。石器以磨制的為多，有斧、錛、鏃。打制石器較少，有鏟、無孔刀、鏃以及磨盤、磨棒。有骨(牙、蚌)器。陶器為手制，多夾砂紅褐陶,器形主要是侈口筒形罐,多飾刻劃的斜線三角紋、人字紋；還有少量泥質紅陶黑彩的彩陶片和個別的泥質黑陶三足觚形器等。獸骨的種類有鹿、獐、狗、豬；貝殼數量很多。據放射性碳素斷代并經校正，中層的年代為公元前4300―前3900年左右。

上層石器以磨制的為主，有斧、帶肩斧、錛、雙孔刀、鏃。打制石器僅有網墜及磨棒。還發現了骨器。陶器為手制，主要是夾砂黑褐陶，多大口或小口的鼓腹罐，還有少量的鼎、豆，紋飾主要為附加堆紋和刻劃紋。獸骨的種類有豬、狗、鹿、獐，以豬為多；也有大量貝殼，并有極少的鯨骨。

遺物意義

從遺物可以看出，當時已有一定的原始農業，飼養狗、豬等家畜，漁獵占相當大的比重。此外，從中層的三足觚形器和上層的三環足盆等，可看出分別受到大汶口文化和山東龍山文化的影響。