扎塘寺位于西藏自治區山南地區雅魯藏布江南岸的扎囊縣境內，是藏傳佛教后弘期早期的重要寺院建筑，其中主殿建筑中一層的中心佛堂內保存有11世紀末葉的壁畫，為目前西藏境內發現的后弘期早期保存狀態最好、年代最早的壁畫遺存。

扎塘寺原名“阿丹扎塘寺”，意為五有扎塘寺。五有是相對桑耶寺而言，即桑那寺不具有這些東西。所謂“五有”，一是扎塘寺主殿（即祖拉康）底層轉經回廊的寬度，比桑耶寺的多一弓（寬0.9米）；二是中層轉經回廊繪有千佛像壁畫；三是底層象征龍王卓思堅，四是中層象征南工月杰欽；五是上層象征藥王熱互拉。由此看來，扎塘寺在建筑過程中，還是吸收了不少桑耶寺的建筑風格。

扎塘寺的整個建筑布局，是按照佛教密宗的曼陀羅建造而成，即所謂“壇城”。

扎塘寺是西藏較早的建筑之一，別具風格的壁畫，除在同期的夏魯寺殘存外，其它地區還沒有發現。這些珍貴的歷史文物，對研究西藏早期的壁畫、外來影響、服飾等有極高的參考價值。

主殿坐西朝東，平面呈不規則的“十”字形·。原高三層，現僅存一層，其他兩層在十年浩劫時被毀。主殿為石墻，整齊美觀。主殿前面左右兩墻角上部各鑲有一尊半身木獅、齙牙咧嘴，雕刻細膩。寺外墻上還鑲有石刻佛教圖案和人物造像等。第一層主要由門廊、經堂、佛殿、回廊等組成。

扎塘寺是在西藏佛教“后宏期”（十世紀后葉，佛教在藏區復興，是謂“后宏期”佛教）開始不久的1081年創建，位于縣政府所在地。

其創建人是扎囊十二賢人中的扎巴·恩協巴（1012——1090年）。據《青史》記載，扎巴·恩協巴“于王子年（宋真宗大中祥符五年，公年1012年）誕生，他和至尊瑪爾巴是同年生人。此師少年時曾為歐區人牧羊五年，生起覺悟而在漾須師座前出家，起名協繞嘉哇（智勝），在師前聽受毗奈耶約一年時間，繼后在伯父香敦卻壩座前聽受他所知道的諸法。從伯父前剛一求得《夏溫修法》，即獲見本尊。此外對于一切法都略作聽受即能知道而，成為殊勝的通達。他從‘耶’區開始至約區方面修建了很多寺廟。伯父逝世后，他不樂意在山谷寺廟中住持寺座，而和納地旅店的女店主同居，修筑新房，講說許多“密續經釋”；并建造勝樂金剛像如喜金剛像十萬尊。從那里出有許多雅隴（地方）方面的弟于，并匯集了許多求學“密續經釋”的學人。有一弟子迎請他到雅隴地方，他生起了大福澤，以此獲得格西扎巴（富有的善知識）的名稱。中間有一段時間他和當已桑杰及班抵達·達哇貢波（月估主）二師相會面，在當巴師座前供上許多黃金，當巴雖未飲受，但仍將息結派（十一世紀初，印度佛學家當巴桑杰入藏創息結派，以修行般若經義，斷除一切苦惱生死涅盤命名的佛教派系）九種明燈法門教授傳給他：達哇貢波也將《六支瑜伽教授》傳賜與他，他依教授精修而獲證大智。……他年屆七十歲時歲次辛酉（公元1081年）為扎塘寺尊基，直到他年屆七十九歲時被一弟子用筷穿其心而逝世時，寺廟大體完成下一些須作的工程，則由其侄郡協和郡楚二人于癸酉（公元1093年）以前的三年中全部完成，總建此寺的時間計經十三年”。

扎巴·恩協已原為噶當派僧，后得當巴桑杰傳授息結法要，遂自成一派稱為扎巴派。