藥品生物技術專業就業方向主要是在生物醫藥及相關生物產品單位從事藥品生產操作、藥品質量控制、藥品質量檢驗、藥品安全防護、產品營銷及售后服務等工作。
藥品生物技術專業就業方向有：生物醫療器械企業、生物制藥企業、食品生物企業、生物環保企業、生物農業企業、企事業單位實驗室、醫院檢驗部門等單位，從事微生物發酵控制、疾病診斷、免疫檢測、生物產品分離純化、環境生物檢測、生物產品制備研發及工藝設計輔助、生產組織與管理、食品藥品營銷等工作；
藥品生物技術專業可以繼續在國內深造，攻讀生物、醫藥、食品等相關專業的碩士學位;
藥品生物技術專業可以出國深造，攻讀生物、醫藥、食品等相關專業的碩/博士學位。
藥品生物技術專業就業前景主要是在醫藥、制藥類企業從事藥品生產、藥品檢驗、藥物分析、質量管理、微生物發酵控制、疾病診斷、免疫檢測、生物產品分離純化、生物產品制備研發及工藝設計輔助等工作。
藥品生物技術專業特色是生物制藥已成為國際和國內增長最快的行業之一，21世紀是生物技術的世紀，藥品生物技術已成為中國高新技術發展的重點。隨著傳統化學制藥黃金時代的結束，新化學藥品數量下降，而藥品生物技術成為當今最活躍和發展最迅速的領域。
